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Les libertés d'étudier et modifier un logiciel signifient un ac au code source du logiciel. Avec l'ac au code source, les logiciels sont généralement disés sous une forme compilée en langage machine, prêts à être exécutés par un ordinateur. Mais le langage machine est très peu lisible par l'homme et rend l'étude du logiciel excessivement pénible voire impossible. l'ac au code source est donc une condition nécessaire pour permettre à l'utilisateur de savoir ce que le programme fait réellement
Le logiciel libre a pour objectif de permettre à l'utilisateur d'avoir le contrôle sur son ordinateur et sur les logiciels qu'il utilise24, 25. Ce contrôle est accordé individuellement : chacun peut étudier en détail ce que fait le logiciel, et le modifier s'il le souhaite. Mais les utilisateurs ont aussi le contrôle de manière collective sur leur ordinateur26 : on ne peut étudier l'ensemble des logiciels que l'on utilise, mais on peut être certain que si un logiciel contient une fonctionnalité cachée ou malveillante, elle sera découverte un jour et un correctif sera préconisé. Le but est de dissuader, la plupart du temps, les développeurs d'ajouter de telles fonctionnalités27.
Richard Stallman conçoit qu'en se servant des logiciels propriétaires, les utilisateurs perdent la possibilité de contrôler une partie de leur propre vie28. Les propriétaires de logiciels propriétaires (les développeurs, ou l'entreprise pour laquelle ils travaillent) ont le pouvoir d'espionner ou de restreindre les utilisateurs29. La définition du logiciel libre par la fsf est la suivante: « Quand les utilisateurs ne contrôlent pas le programme, c'est le programme qui contrôle les utilisateurs. Le développeur contrôle le programme, et par ce biais, contrôle les utilisateurs. Ce programme non libre, ou « privateur », devient donc l'instrument d'un pouvoir injuste. »
Le 25 octobre 2013, dans l'émission Ce soir (ou jamais !), cette notion de contrôle fait débat entre Jacques Attali et Jérémie Zimmermann. Jacque Attali affirme "Le mot libre est très mal adapté car les logiciels dit libres sont souvent attachés à une seule entreprise". Selon Jérémie Zimmermann "la liberté pour les logiciels c'est un vrai concept [...] ce que ça veut dire c'est contrôler la machine plutôt que de se laisser contrôler par elle", ce au-quoi réponds Attali que "Si vous laissez chacun avoir la possibilité de contrôler sa confidentialité alors vous rendez impossible l'état de droit"
La qualité du logiciel se rapporte au nombre de développeurs. Plus la communauté de développement s'agrandit, plus elle devient un gage de qualité et de réactivité. De la sorte, la communauté des utilisateurs, ayant comme rôle principal de déer les dysfonctionnements et les suggestions, a une influence proportionnelle à sa taille.